python模拟朴素贝叶斯程序举例分析
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朴素贝叶斯思想:运用了条件概率公式P(Y,X) = P(Y)P(X|Y)。由样本分别求得P(Y)和P(X|Y),进而估计出在X条件下Y的概率。不同Y对应的概率的最大值就是我们想要的X的分类。换句话说,我们想要知道X的分类,那么通过样本求出不同类别(即不同Y)时的P(Y)和P(X|Y),然后计算X发生条件下,可能类别Y的概率,最大的概率就是我们预测的概率。
注意,通常X对应很多分量,X=(X1,X2,······)。这时候贝叶斯估计假设:用于分类的特征在类确定的条件下是条件独立的。所以上面的P(X|Y)计算公式为:
朴素贝叶斯代码的实现
import numpy as np import pandas as pd import math import matplotlib.pyplot as plt from sklearn.datasets import load_iris from sklearn.model_selection import train_test_split class NaiveBayes: def __init__(self): self.model = None # 数学期望 @staticmethod def mean(X): return sum(X) / float(len(X)) # 标准差 def stdev(self, X): avg = self.mean(X) return math.sqrt(sum([pow(x - avg, 2) for x in X]) / float(len(X))) # 概率密度函数 def gaussian_probability(self, x, mean, stdev): exponent = math.exp(-(math.pow(x - mean, 2) / (2 * math.pow(stdev, 2)))) return (1 / (math.sqrt(2 * math.pi) * stdev)) * exponent # 分类别求出数学期望和标准差 def summarize(self, train_data): a = list(zip(*train_data)) summaries = [(self.mean(i), self.stdev(i)) for i in zip(*train_data)] # *train_data将train_data拆分成n个一维数组 # 再将这个一维数组压缩在一起。 # 注意:这里压缩的时候,一共压缩成了四个一维数组, # 即每个原数组的第一维进行压缩,每个原数组的第二维进行压缩······ # 然后分别对四个一维数组进行求均值和标准差,即对四个特征求响应的数字特征 return summaries # 处理X_train,y_train def fit(self, X, y): labels = list(set(y)) # set将y删除掉重复的,list将set结果转成列表。这里labels=[0.0, 1.0] data = {label: [] for label in labels} # 转成字典。输出{0.0: [], 1.0: []} for f, label in zip(X, y): data[label].append(f) # 将上面的字典添加属于这个类的值。即类型是label的f self.model = { label: self.summarize(value) for label, value in data.items() # 从上述字典中,一个label及其对应的属于这个label的数据,进行数字特征的计算 # 结果格式: {0:[(均值, 标准差), (均值, 标准差), (均值, 标准差), (均值, 标准差)], # 1: [(均值, 标准差), (均值, 标准差), (均值, 标准差), (均值, 标准差)]} # 0后边的四项分别对应:label是0的样品的四个特征的均值和标准差 } return 'gaussianNB train done!' # 计算概率 def calculate_probabilities(self, input_data): probabilities = {} for label, value in self.model.items(): probabilities[label] = 1 for i in range(len(value)): mean, stdev = value[i] probabilities[label] *= self.gaussian_probability( input_data[i], mean, stdev) return probabilities # 类别 def predict(self, X_test): label = sorted( self.calculate_probabilities(X_test).items(), key=lambda x: x[-1])[-1][0] return label def score(self, X_test, y_test): right = 0 for X, y in zip(X_test, y_test): label = self.predict(X) if label == y: right += 1 if right / float(len(X_test))==1.0: return "perfect!" else: return right / float(len(X_test)) def create_data(): iris = load_iris() df = pd.DataFrame(data=iris.data, columns=iris.feature_names) df['label'] = iris.target df.columns = ['sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width', 'label'] data = np.array(df.iloc[:100, :]) return data[:, :-1], data[:, -1], df X, y, DF = create_data() X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3) model = NaiveBayes() model.fit(X_train, y_train) print(model.score(X_test, y_test))
结果比较理想
直接运用sklearn中现有的包进行模拟
import numpy as np import pandas as pd from sklearn.datasets import load_iris from sklearn.model_selection import train_test_split from sklearn.naive_bayes import GaussianNB from sklearn.naive_bayes import BernoulliNB, MultinomialNB # 伯努利模型和多项式模型 # data def create_data(): iris = load_iris() df = pd.DataFrame(iris.data, columns=iris.feature_names) df['label'] = iris.target df.columns = [ 'sepal length', 'sepal width', 'petal length', 'petal width', 'label' ] data = np.array(df.iloc[:100, :]) return data[:, :-1], data[:, -1] X, y = create_data() X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3) clf = GaussianNB() clf.fit(X_train, y_train) print("GaussianNB:") print(clf.score(X_test, y_test)) print(clf.predict([[4.4, 3.2, 1.3, 0.2]])) clf2 = BernoulliNB() clf2.fit(X_train, y_train) print("\nBernoulliNB:") print(clf2.score(X_test, y_test)) print(clf2.predict([[4.4, 3.2, 1.3, 0.2]])) clf3 = MultinomialNB() clf3.fit(X_train, y_train) print("\nMultinomialNB:") print(clf3.score(X_test, y_test)) print(clf3.predict([[4.4, 3.2, 1.3, 0.2]]))
输出结果
GaussianNB: 1.0 [0.] BernoulliNB: 0.4666666666666667 [1.] MultinomialNB: 1.0 [0.]
可以看到,高斯模型和多项式模型较好的进行了预测,但是伯努利模型预测结果较差。
原因:数据不符合伯努利分布。
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