IARCTP53数据库的示例分析
IARC TP53数据库的示例分析,很多新手对此不是很清楚,为了帮助大家解决这个难题,下面小编将为大家详细讲解,有这方面需求的人可以来学习下,希望你能有所收获。
创新互联公司专注为客户提供全方位的互联网综合服务,包含不限于网站设计制作、网站设计、长乐网络推广、微信小程序定制开发、长乐网络营销、长乐企业策划、长乐品牌公关、搜索引擎seo、人物专访、企业宣传片、企业代运营等,从售前售中售后,我们都将竭诚为您服务,您的肯定,是我们最大的嘉奖;创新互联公司为所有大学生创业者提供长乐建站搭建服务,24小时服务热线:028-86922220,官方网址:www.cdcxhl.com
TP53基因,也称之为P53, 是一种抑癌基因,编码一种分子量为53KDa的蛋白质,介导细胞凋亡过程,通过介导癌细胞的凋亡过程,实现抑癌作用。作为最易突变和最重要的肿瘤抑制基因,TP53基因相关突变研究的非常全面和深入。IARC TP53 database收集整理里文献发表和公共数据库中收录的TP53基因上的变异位点,数据库网址如下
http://p53.iarc.fr/Scope.aspx
该数据库收录了以下几种TP53基因相关变异信息
癌症样本中的somatic mutations
癌症患者,家属以及对照的正常样本中的germline mutations
human中常见的TP53多态位点
TP53突变蛋白的功能评级
不同细胞系中TP53基因的突变信息
小鼠模型中的TP53基因突变信息
实验证据支持的突变
同时还收录肿瘤患者的临床病理信息,生存数据等相关信息。通关官网的检索系统可以灵活的检索数据,最基本的检索方式是利用突变位点的描述信息,示意如下
可以输入一个或者多个不同水平的突变描述信息进行检索,以C.524G>A
为例,检索结果示意如下
给出了对应的genomic, cdnA, protein3个水平的描述,对应的外显子位置,功能影响,和clinvar, cosmic, dbsnp, genomeAD等数据库的链接。除此之外,也可以根据突变位点的不同特征进行检索,示意如下
可以根据碱基突变的类型,所处的外显子,突变是否有害,染色体位置等多种条件进行检索,检索结果的table形式和第一种检索结果相同,对于多个检索结果,可以查看其突变特征和在不同肿瘤中的分布
1. Mutation distribution
查看以下两种信息的分布
Mutation type
Mutation effects
Mutation type的结果示意如下
Mutation effects的结果示意如下
2. Tumor distribution
查看somatic mutations和germline mutations在各种肿瘤上的分布,结果以柱状图展现,结果示意如下
如果需要深入研究TP53基因的相关突变,该数据库非常值得参考。
看完上述内容是否对您有帮助呢?如果还想对相关知识有进一步的了解或阅读更多相关文章,请关注创新互联行业资讯频道,感谢您对创新互联的支持。
当前题目:IARCTP53数据库的示例分析
标题URL:http://hbruida.cn/article/pjshgi.html