python怎么实现K-means算法
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K-means 聚类算法
特点
对初始化敏感。初始点选择的不同,可能会产生不同的聚类结果
最终会收敛。不管初始点如何选择,最终都会收敛
算法思想
选择K个点作为初始质心
repeat
将每个点指派到最近的质心,形成K个簇
重新计算每个簇的质心
until 簇不发生变化或达到最大迭代次数
代码实现
实验目的
根据下列成绩单,将5名同学成绩归为A类、B类、C类。
限制:使用Kmeans算法实现,但不直接调用sklearn第三方库的KMeans函数。
学生姓名 小测1 小测2 小测3 期末成绩 项目答辩 成绩
张三 12 15 13 28 24 ?
李四 7 11 10 19 21 ?
王五 12 14 11 27 23 ?
赵六 6 7 4 13 20 ?
刘七 13 14 13 27 25 ?
实验步骤
1. 数据准备
将数据储存为csv文件,格式如下
学生姓名,小测1,小测2,小测3,期末成绩,项目答辩
张三,12,15,13,28,24
李四,7,11,10,19,21
王五,12,14,11,27,23
赵六,6,7,4,13,20
刘七,13,14,13,27,25
在从csv文件中读取数据,并选取可用的数据(排除姓名列)
data = pd.read_csv('grade.csv')
new_data = data.iloc[:, 1:].values
2. KMeans算法实现
KMeans算法涉及两点之间距离的计算,我们提前写好一个函数:输入两个点的坐标,返回两点之间的欧氏距离
def eucliDist(A, B):
return math.sqrt(sum([(a - b) ** 2 for (a, b) in zip(A, B)]))
函数k_means(c,data,max,label)实现KMeans算法:
a. 输入:质心列表c,待聚类数据data,最大迭代次数max,标签列表label
b. 计算data中的每个点分别到3个质心的欧式距离,得到一个矩阵metrix
metrix = [[eucliDist(a, b) for a in data] for b in c]
c. 比较矩阵metrix同一列的数值大小,将对应的学生划归距离较短的质心所属的类,将标签存储为列表.
classifier = []
for (d, e, f) in zip(metrix[0], metrix[1], metrix[2]):
m = min(d, e, f)
if d == m:
classifier.append(label[0])
elif e == m:
classifier.append(label[1])
else:
classifier.append(label[2])
d. 重新计算质心的坐标,新质心的坐标=被划归同一类点的坐标的平均值
n1, n2 = 0, 0
c1 = [0, 0, 0, 0, 0]
c2 = c1
c3 = c1
for i in range(0, num):
if classifier[i] == label[0]:
c1 = [a + b for (a, b) in zip(c1, data[i])]
n1 = n1 + 1
elif classifier[i] == label[1]:
c2 = [a + b for (a, b) in zip(c2, data[i])]
n2 = n2 + 1
else:
c3 = [a + b for (a, b) in zip(c3, data[i])]
c1 = [a / n1 for a in c1]
c2 = [a / n2 for a in c2]
c3 = [a / (num - n1 - n2) for a in c3]
e. 重复b~d,直到质心坐标不再变化或达到最大迭代次数
f. 返回标签列表
完整函数如下
def k_means(c, data, max,label):
# a. 输入质心列表c,待聚类数据`data`,最大迭代次数max
max = max - 1
num = len(data)
# b. 计算data中的每个点分到k个质心的距离,得到一个矩阵,如
metrix = [[eucliDist(a, b) for a in data] for b in c]
print(metrix)
# c. 比较矩阵同一列的数值大小,将对应的学生划归距离较短的质心所属的类,将标签存储为列表
classifier = []郑州做人流手术费用 http://4g.zyfuke.com/
for (d, e, f) in zip(metrix[0], metrix[1], metrix[2]):
m = min(d, e, f)
if d == m:
classifier.append(label[0])
elif e == m:
classifier.append(label[1])
else:
classifier.append(label[2])
print(classifier)
# d. 重新计算质心的坐标,新质心的坐标=被划归同一类点的坐标的平均值
n1, n2 = 0, 0
c1 = [0, 0, 0, 0, 0]
c2 = c1
c3 = c1
for i in range(0, num):
if classifier[i] == label[0]:
c1 = [a + b for (a, b) in zip(c1, data[i])]
n1 = n1 + 1
elif classifier[i] == label[1]:
c2 = [a + b for (a, b) in zip(c2, data[i])]
n2 = n2 + 1
else:
c3 = [a + b for (a, b) in zip(c3, data[i])]
c1 = [a / n1 for a in c1]
c2 = [a / n2 for a in c2]
c3 = [a / (num - n1 - n2) for a in c3]
print(max)
print([c1,c2,c3])
# e. 重复b~d,直到质心坐标不再变化,或达到最大迭代次数
if c != [c1, c2, c3] and max > 0:
c = [c1, c2, c3]
print(c)
k_means(c, data, max, label)
return classifier
3. 设置参数,调用函数,得到结果
设置初始质心、标签列表、最大迭代次数
# 选择K个点作为初始质心
c = [[12, 15, 13, 28, 24], [ 7, 11, 10, 19, 21],[12, 14, 11, 27, 23]]
label = ['A', 'B', 'C']
max = 20
调用函数,整理结果
grade = k_means(c, new_data, max, label)
grade = pd.Series(grade, index=data['学生姓名'])
print(grade)
实验结果
初始质心为[12, 15, 13, 28, 24], [ 7, 11, 10, 19, 21],[12, 14, 11, 27, 23]时,迭代2次即收敛,结果如下
学生姓名 小测1 小测2 小测3 期末成绩 项目答辩 成绩
张三 12 15 13 28 24 A
李四 7 11 10 19 21 B
王五 12 14 11 27 23 C
赵六 6 7 4 13 20 B
刘七 13 14 13 27 25 A
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